来自哈佛医学院和美国其他机构的研究人员对数千种肠道细菌的全基因组进行了测序,以发展和验证微生物的深层衰老时钟。研究人员说,研究结果表明,宿主年龄是影响肠道菌群动态变化的一个重要因素。相关论文最近在iScience上发表。
肠道细菌是影响人体免疫功能、脑发育和活动、中枢代谢、肥胖等生理过程的主要因素,加强对肠道菌群影响因素的认识和控制具有重要意义。
影响肠道菌群的因素包括出生模式、饮食、体力活动和年龄。特别是成年后,在饮食、吸烟、饮酒和体育活动的影响下,肠道菌群有很大的个体差异。目前,许多研究已经确定了与宿主年龄有关的肠道菌群的一些变化。然而,这些研究主要是基于局部抽样,结果可能并不普遍。
这项新的研究总结了13项与人类肠道微生物有关的公共研究数据,并根据微生物的相对丰度开发了老化时钟。研究人员使用交叉验证方法训练了1100多个不同微生物群的训练深度神经网络,并通过独立的数据集检验了集成模型,寄主年龄预测的平均误差为5.9年≤6.8年。结果表明,在成年人群中,微生物群落与年龄增长有关的演替规律。
研究人员指出,研究结果可以训练其他平台的数据,并创建类似的模型,以探讨特定细菌种类在更可控的环境中对人类衰老的影响。他们还提出了识别有可能加速或减缓衰老的微生物的方法。
我们很高兴开发出一种新的微生物老化时钟,它开创了这个行业。我们希望这些结果将用于未来的长寿研究,以跟踪不同干预措施和饮食对肠道年龄预测的影响。参与这项研究的InsiloMedicine的AlexZavoronkov说。